Collegium Novum to główny gmach Uniwersytetu Jagiellońskiego, siedziba jego władz rektorskich i dziekańskich. Powstał na miejscu średniowiecznych burs Jeruzalem i Filozofów. Zbudowany w stylu neogotyckim w latach 1873-1887 według projektu Feliksa Księżarskiego zawiera w sobie monumentalną klatkę schodową oraz aulę z bogatym wyposażeniem, obejmującym m.in. portrety polskich królów i najwybitniejszych uczonych oraz obraz Jana Matejki przedstawiający Mikołaja Kopernika podczas obserwacji nieba. W sali tej odbywają się uroczyste inauguracje roku akademickiego oraz promocje doktorskie. W położonej na II piętrze sali nr 56, noszącej imię Józefa Szujskiego, znajduje się tablica upamiętniająca pracowników naukowych krakowskich uczelni podstępnie aresztowanych tam przez Niemców 6 listopada 1939 roku w ramach Sonderaktion Krakau, a następnie więzionych w obozie koncentracyjnym.
SKOZK od kilkunastu lat wspiera prace remontowo-konserwatorskie w Collegium Novum. W latach 90. XX wieku odnowiono wszystkie ceglane elewacje oraz przeprowadzono prace konserwatorskie przy kamieniarce i kratach. Naprawiono więźbę dachową i wykonano pokrycie dachu wraz z instalacją odgromową, wykonano prace zabezpieczające strop nad aulą, przeprowadzono kompleksowy remont konserwatorski zespołu auli, korytarzy na wszystkich kondygnacjach oraz sal nr 30, 45, 52, 53 i 56. Odnowiono także jeden z dwóch dziedzińców wewnętrznych. W latach 2010–2012 SKOZK finansował wzmacnianie stropów w salach II piętrze Collegium. Istotnym zamierzeniem konserwatorskim był remont dachu budynku, przy okazji którego przywrócono jego oryginalne pokrycie z dwubarwnego łupka. W 2013 r. wykonano remont konserwatorski portyku ze wzmocnieniem konstrukcyjnym posadowienia, wymianą posadzki i remontem schodów bocznych a także remont konserwatorski posadzki ceramicznej holu wejściowego. W 2014 roku odnowiono elewacje gmachu, a w 2015 roku prowadzono rekonstrukcję stolarki okiennej.
Łącznie w latach 1994–2007 i 2010–2015 SKOZK przeznaczył na prace w Collegium Novum 12 862 410 zł.